Biologisen suodatuksen lopputuote nitraatti on vaaraton pieninä pitoisuuksina. Mikäli osittaisvedenvaihdot ovat liian pieniä, tai liian harvoin suoritettuja, akvaarioon voi kertyä liikaa nitraattia. Pieni pitoisuus 5-20mg/l on suotuisa kasvien kasvulle, yli 50mg/l lisää levien kasvua ja voi haitata kaloja.